Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPB2P35606 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPB2P35606 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPB2P35606 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COPB2P35606 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COPB2P35606 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPB2P35606 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPB2P35606 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPB2P35606 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPB2P35606 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPB2P35606 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPB2P35606 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPB2P35606 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPB2P35606 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPB2P35606 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
COPB2P35606 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPB2P35606 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPB2P35606 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPB2P35606 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPB2P35606 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPB2P35606 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPB2P35606 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPB2P35606 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPB2P35606 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPB2P35606 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPB2P35606 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPB2P35606 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COPB2P35606 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms