Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT9P35527 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT9P35527 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT9P35527 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT9P35527 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT9P35527 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT9P35527 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT9P35527 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT9P35527 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT9P35527 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT9P35527 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT9P35527 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT9P35527 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT9P35527 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT9P35527 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT9P35527 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT9P35527 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT9P35527 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT9P35527 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT9P35527 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT9P35527 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms