Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms