Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFC1P35251 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFC1P35251 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFC1P35251 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFC1P35251 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFC1P35251 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFC1P35251 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFC1P35251 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFC1P35251 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFC1P35251 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFC1P35251 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFC1P35251 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFC1P35251 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFC1P35251 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFC1P35251 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFC1P35251 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFC1P35251 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFC1P35251 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RFC1P35251 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RFC1P35251 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RFC1P35251 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFC1P35251 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RFC1P35251 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFC1P35251 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms