Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA1P35221 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms