Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKBRP32239 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms