Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A4P31645 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms