Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASQ1P31415 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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