Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms