Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA13P31271 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms