Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA9P31269 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms