Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECHS1P30084 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms