Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5DP30049 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5DP30049 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms