Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DNMT1P26358 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DNMT1P26358 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms