Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA2P26232 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA2P26232 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms