Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms