Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4BP23588 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms