Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRGP23470 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRGP23470 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
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