Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCSHP23434 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCSHP23434 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCSHP23434 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCSHP23434 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCSHP23434 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms