Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLDCP23378 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLDCP23378 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLDCP23378 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLDCP23378 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLDCP23378 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLDCP23378 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLDCP23378 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLDCP23378 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLDCP23378 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLDCP23378 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLDCP23378 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLDCP23378 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLDCP23378 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLDCP23378 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLDCP23378 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms