Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB2P22676 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB2P22676 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB2P22676 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB2P22676 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALB2P22676 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALB2P22676 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB2P22676 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB2P22676 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB2P22676 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB2P22676 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB2P22676 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB2P22676 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB2P22676 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB2P22676 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB2P22676 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB2P22676 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB2P22676 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB2P22676 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB2P22676 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB2P22676 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB2P22676 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB2P22676 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALB2P22676 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALB2P22676 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALB2P22676 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALB2P22676 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALB2P22676 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALB2P22676 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALB2P22676 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms