Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms