Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms