Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NCLP19338 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCLP19338 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCLP19338 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCLP19338 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCLP19338 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCLP19338 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCLP19338 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCLP19338 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCLP19338 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCLP19338 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCLP19338 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCLP19338 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCLP19338 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCLP19338 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCLP19338 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCLP19338 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCLP19338 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCLP19338 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCLP19338 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCLP19338 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCLP19338 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCLP19338 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCLP19338 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCLP19338 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCLP19338 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCLP19338 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCLP19338 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCLP19338 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCLP19338 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCLP19338 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCLP19338 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCLP19338 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCLP19338 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCLP19338 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCLP19338 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCLP19338 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCLP19338 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCLP19338 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms