Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHCEP18577 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHCEP18577 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHCEP18577 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHCEP18577 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHCEP18577 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHCEP18577 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHCEP18577 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHCEP18577 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHCEP18577 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHCEP18577 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHCEP18577 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHCEP18577 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHCEP18577 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHCEP18577 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RHCEP18577 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHCEP18577 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RHCEP18577 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHCEP18577 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms