Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB4P17483 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms