Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A2P16615 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms