Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDE6AP16499 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms