Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB4P16144 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms