Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC130P13994 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms