Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEACAM1P13688 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM1P13688 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms