Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms