Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms