Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOP2AP11388 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOP2AP11388 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms