Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TOP1P11387 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOP1P11387 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP1P11387 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP1P11387 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1P11387 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1P11387 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1P11387 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1P11387 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1P11387 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1P11387 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1P11387 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1P11387 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1P11387 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1P11387 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1P11387 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1P11387 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1P11387 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1P11387 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1P11387 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1P11387 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1P11387 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1P11387 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1P11387 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1P11387 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1P11387 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1P11387 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1P11387 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1P11387 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1P11387 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP1P11387 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP1P11387 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP1P11387 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP1P11387 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP1P11387 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1P11387 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1P11387 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1P11387 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1P11387 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms