Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM1P11229 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms