Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF1P10914 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF1P10914 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF1P10914 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF1P10914 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF1P10914 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF1P10914 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF1P10914 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF1P10914 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF1P10914 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF1P10914 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF1P10914 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF1P10914 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF1P10914 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF1P10914 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF1P10914 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF1P10914 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF1P10914 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF1P10914 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF1P10914 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF1P10914 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms