Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GLI3P10071 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GLI3P10071 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GLI3P10071 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GLI3P10071 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GLI3P10071 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GLI3P10071 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GLI3P10071 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GLI3P10071 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GLI3P10071 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GLI3P10071 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GLI3P10071 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GLI3P10071 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GLI3P10071 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GLI3P10071 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GLI3P10071 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GLI3P10071 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GLI3P10071 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GLI3P10071 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GLI3P10071 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GLI3P10071 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GLI3P10071 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GLI3P10071 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GLI3P10071 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GLI3P10071 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GLI3P10071 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GLI3P10071 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GLI3P10071 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GLI3P10071 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GLI3P10071 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GLI3P10071 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GLI3P10071 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GLI3P10071 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GLI3P10071 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GLI3P10071 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GLI3P10071 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GLI3P10071 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GLI3P10071 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GLI3P10071 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GLI3P10071 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GLI3P10071 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GLI3P10071 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GLI3P10071 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GLI3P10071 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GLI3P10071 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GLI3P10071 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GLI3P10071 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GLI3P10071 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
GLI3P10071 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms