Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBBP0CG47 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms