Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM200BP0CF97 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms