Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VIL1P09327 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIL1P09327 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VIL1P09327 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VIL1P09327 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VIL1P09327 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIL1P09327 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIL1P09327 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIL1P09327 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VIL1P09327 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIL1P09327 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIL1P09327 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIL1P09327 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIL1P09327 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VIL1P09327 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIL1P09327 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIL1P09327 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIL1P09327 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIL1P09327 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIL1P09327 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIL1P09327 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms