Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP3A4P08684 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP3A4P08684 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms