Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MGPP08493 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MGPP08493 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MGPP08493 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MGPP08493 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MGPP08493 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MGPP08493 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MGPP08493 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MGPP08493 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MGPP08493 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MGPP08493 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MGPP08493 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MGPP08493 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MGPP08493 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MGPP08493 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MGPP08493 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MGPP08493 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MGPP08493 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MGPP08493 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MGPP08493 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MGPP08493 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MGPP08493 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms