Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOP08100 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOP08100 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOP08100 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOP08100 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOP08100 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOP08100 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOP08100 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOP08100 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOP08100 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOP08100 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOP08100 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOP08100 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOP08100 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOP08100 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOP08100 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOP08100 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOP08100 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOP08100 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOP08100 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOP08100 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOP08100 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOP08100 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOP08100 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOP08100 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOP08100 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOP08100 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOP08100 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOP08100 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOP08100 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOP08100 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOP08100 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOP08100 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOP08100 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOP08100 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOP08100 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOP08100 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOP08100 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOP08100 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOP08100 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms