Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSLP07711 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSLP07711 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSLP07711 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSLP07711 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSLP07711 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSLP07711 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSLP07711 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSLP07711 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSLP07711 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSLP07711 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSLP07711 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSLP07711 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSLP07711 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms