Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLK3P07288 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLK3P07288 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLK3P07288 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLK3P07288 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLK3P07288 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLK3P07288 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLK3P07288 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLK3P07288 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLK3P07288 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms