Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAVP06756 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms