Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR3DP05423 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms