Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13BP05160 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F13BP05160 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F13BP05160 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F13BP05160 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
F13BP05160 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
F13BP05160 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
F13BP05160 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
F13BP05160 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13BP05160 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13BP05160 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13BP05160 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13BP05160 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13BP05160 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13BP05160 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13BP05160 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13BP05160 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13BP05160 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13BP05160 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13BP05160 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F13BP05160 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F13BP05160 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F13BP05160 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
F13BP05160 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F13BP05160 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13BP05160 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13BP05160 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13BP05160 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13BP05160 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13BP05160 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13BP05160 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F13BP05160 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F13BP05160 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
F13BP05160 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms