Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA4P05014 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms